Update README, plot

data/README.md

@@ -23,7 +23,7 @@ directement en modifiant le contenu de la variable `const`.
 `orbitals.py` permet de tracer la trajectoire de la bouée lors du passage de la vague scélérate identifiée en 2 et 3
 dimensions.
 
-`python -m processing.orbitals [-c CONFIG] [-v]`
+```python -m processing.orbitals [-c CONFIG] [-v]```
 
 * `-c CONFIG` : choix d'un fichier de configuration (`.ini`)
 * `-v` : verbose
@@ -36,3 +36,20 @@ raw_ts : liste des chemins vers les fichiers de données brutes de la bouée
 [out]
 root : racine des fichiers de sortie
 ```
+
+### Plot
+`plot.py` permet de tracer la bathymétrie locale en 2 dimensions.
+
+```python -m processing.plot [-c CONFIG] [-v]```
+
+* `-c CONFIG` : choix d'un fichier de configuration (`.ini`)
+* `-v` : verbose
+
+```
+[inp]
+root : racine des fichiers d'entrée
+
+[out]
+root : racine des fichiers de sortie
+sub : sous-domaine de bathymétrie, doit être généré avec subdomain
+```

data/processing/plot.py

@@ -25,11 +25,6 @@ config.read(args.config)
 inp_root = pathlib.Path(config.get("inp", "root"))
 out_root = pathlib.Path(config.get("out", "root"))
 bathy_inp = out_root.joinpath(config.get("out", "sub"))
-hires_inp = inp_root.joinpath(config.get("inp", "hires"))
-hstru_inp = inp_root.joinpath(config.get("inp", "hstru"))
-poro_inp = inp_root.joinpath(config.get("inp", "poro"))
-psize_inp = inp_root.joinpath(config.get("inp", "psize"))
-bathy_out = inp_root.joinpath(config.get("out", "out"))
 
 log.info(f"Loading bathymetry from {bathy_inp}")
 bathy_curvi = np.load(bathy_inp)
@@ -72,5 +67,5 @@ fig.colorbar(c, label="z (m)")
 ax.set_aspect("equal")
 ax.set_rasterization_zorder(1.5)
 
-fig.savefig("bathy2d.pdf")
+fig.savefig(out_root.joinpath("bathy2d.pdf"))
 plt.show()